Existe uma versão modificada do notify-osd que permite configurar alguns parâmetros, como tempo limite, posição, cores, etc ...
Vou copiar aqui as informações que salvei há alguns meses para a instalação:
Website com as informações:
PPA's:
Instalação:
Instale o NotifyOSD corrigido para o Ubuntu:
sudo add-apt-repository ppa:leolik/leolik
sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade
sudo apt-get install libnotify-bin
pkill notify-osd
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Instale o NotifyOSDConfig (uma GUI para configurar o NotifyOSD corrigido):
sudo add-apt-repositório ppa: nilarimogard / webupd8 sudo apt-get update sudo apt-get instala o notifyosdconfig
Agora inicie o NotifyOSDConfig e comece a refinar as bolhas de notificação do NotifyOSD.
O recurso close-on-click não está habilitado por padrão, portanto, se você quiser usá-lo, ative-o no NotifyOSDConfig!
NotifyOSDConfig não vem com configurações para mover as bolhas de notificação, portanto, você deve fazer isso manualmente, usando o comando abaixo:
gsettings set com.canonical.notify-osd gravity [number]
onde [number] pode ser:
1 - canto superior direito 2 - meio-direita 3 - canto inferior direito 4 - canto inferior esquerdo 5 - meio-esquerda 6 - canto superior esquerdo
Espero que ajude. Só acho que posso dizer, está trabalhando em 13.04, eu não tentei em 13.10. Os repositórios têm pacotes para ambas as versões, então não deve ser um problema.
Boa sorte!