Resposta curta: Infelizmente, você não pode.
Resposta longa: Tecnicamente, se você alterar a função do alt da esquerda, você também teria que alterar o atalho de teclado do alternador de aplicativos para algo que não usa as teclas alt.
Por fim, não sei se você sabe que também pode usar o System Settings > Keyboard Layout > Options...
para editar todos os tipos de material relacionado ao layout do teclado.