A linha completa é:
This helps start your PC faster after shutdown. Restart isn't affected.
A primeira frase diz que a opção afeta o sistema depois de ser ligada a partir de um desligamento . Uma reinicialização não é um desligamento do sistema, é uma reinicialização.
Então, como está escrito, a opção não afetará os reinícios.
Talvez confira esta outra pergunta do SU para obter mais informações relacionadas a desligamentos e reinicializações: Diferença entre desligar e ligar vs. reiniciar no Windows 8?