O problema é o esquema de partição padrão usado pelo Mac quando você criou as partições. O Mac OS X usa o esquema de mapas GPT (GUID Partition Table, compatível com EFI), e é por isso que há uma partição GPT.
O Windows gosta muito de MBR (Master Boot Records) - e o Mac OS X também pode lidar com eles. Então você tem que reparticionar seu disco rígido externo (você perde todos os dados, ou compra iPartition - ele pode mudar os esquemas de partição sem perder os dados).
Se você particionar essa unidade no Mac OS X com o Utilitário de Disco, clique em 'Opções' na janela 'Partição'. Lá você pode escolher entre 'GUID Partition Table', 'Apple Partition Map' e 'Master Boot Record'. E o último é o que você quer.
Depois, o Windows (e o Mac OS X também) verá a partição NTFS.