scp [user@]vps.example.com:name.zip ~/Documents/Backup/ fará o que você quiser.
A página de manual scp(1) tem os detalhes, mas a sintaxe scp ${from} ${to} , em que from e to são da forma: ${host}:${path} ou ${path} .
Você também pode estar interessado em sftp , que é uma experiência interativa semelhante a FTP, em vez da linha de comando scp experience; sftp vps.example.com vai te levar até lá.