Eu encontrei uma solução. É possível com o OSFMount . Depois de instalado em uma máquina uma vez, basta copiar OSFMount.com e OSFMount.sys do diretório de instalação para torná-lo portátil.
Meu script em lote é assim:
@echo off
set disk1=\path\to\my\disk1.iso
set disk2=\path\to\my\disk2.iso
set drive1=M:
set drive2=N:
.\OSFMount.com -a -t file -f %disk1% -m %drive1%
.\OSFMount.com -a -t file -f %disk2% -m %drive2%
%drive1%\setup.exe -silent -media_dir2 %drive2%
.\OSFMount.com -d -m %drive1%
.\OSFMount.com -d -m %drive2%
exit 0