Is it a good idea to shut down or put to sleep my PC seconds after some very heavy processing load on the CPU or GPU?
Não é uma má ideia ou uma boa ideia. Um PC foi projetado para ser desligado, colocado no modo de suspensão e permanecer ligado. Sendo usado em 100% de carga ou 0% de carga não faz diferença, é projetado para ser usado, qualquer falha não será vinculada ao tipo de trabalho que faz.
I'm asking this because i'm not sure if the cooling system has enough time to cool the components down to an acceptable temperature before the shut down; that would mean that the components might even be damaged or have their lifespan significantly reduced due to insufficient cooling.
Se a eletricidade está passando por um circuito, e a temperatura dos correspondentes está dentro de suas especificações, então não ter eletricidade e a temperatura ainda dentro das especificações não faz diferença. Seu PC irá se refrescar mais rápido, sem ser ligado, por razões óbvias. Eu deixei meus últimos 4 computadores, abrangendo mais de 20 anos, ligados 24/7/365.
Se o sistema é resfriado o suficiente para manter o sistema estável por 12 horas por dia, então é estável o suficiente para funcionar 24/7/365.
Should i worry about this or does the hardware is smart enough not to shut down the cooling before it reaches an acceptable temperature?
Não há nada para se preocupar. O sistema de resfriamento, em um sentido geral, não se importa se o sistema está com 100% de carga ou 50% de carga, ele continuará a resfriar o sistema, não importa o que aconteça.
Você entende, o hardware não é inteligente o suficiente para fazer qualquer coisa que não foi projetado para fazer, certo?