Os sinais sonoros ou sinais de erro (às vezes são de led) usam métodos diferentes dependendo da marca, placa-mãe, chipset, etc. Por isso nem sempre funciona ao usar fones de ouvido, mas deve haver um alto-falante interno que sempre é usado se nenhum cabo estiver conectado, a menos que este alto-falante esteja faltando na placa-mãe.
Então, basicamente, você não deve confiar apenas nos fones de ouvido para ouvir os bips de erro.