Remover qualquer unidade enquanto a desfragmentação pode causar danos ao sistema de arquivos. Quando você desfragmenta uma unidade, o computador está constantemente lendo dados da unidade e gravando-os em diferentes partes da unidade. Portanto, se você remover a unidade durante esse processo, há uma grande possibilidade de que os dados lidos não sejam gravados e haja corrupção. Você deve sempre parar de desfragmentar antes de remover uma unidade.
Além disso, se você não tiver um conjunto de unidades removíveis para remoção rápida no Windows, retirá-lo antes de desmontá-lo também pode causar danos ao arquivo.