As pastas Arquivos de Programas do Microsoft SQL Server são seguras para excluir porque você removeu o programa e, portanto, tudo o que resta é apenas para fins de cache pelos instaladores ou arquivos que foram modificados e o desinstalador não os removeu porque às vezes você possui configurações personalizadas arquivos .ini que salvam certas informações, é demais para explicar lol, mas novamente, deve ser 100% seguro excluir, considerando as suas circunstâncias. Você não mencionou se instalou o SQL Server para um requisito ou apenas para tentar algo, porque se um programa diferente instalou o SQL Server para você, ele pode ter instalado a versão expressa que apenas instala uma instância do SQL e é requerida por outros programas que usam bancos de dados. Mas se isso não se aplica a você, você deve ser bom.