Você não precisa marcar setores defeituosos manualmente. Os discos rígidos têm um pool de setores bons e de reposição. Quando setores ruins são encontrados, eles são automaticamente sinalizados e substituídos por outros bons. Tudo isso é invisível para o usuário.
FYI, você pode usar ferramentas como Crystaldiskinfo e HD tune para monitorar setores defeituosos, se a unidade for habilitada para SMART (a maioria das unidades são). No entanto, por favor, também execute um diagnóstico de HDD (dependendo da marca do seu HDD).
Ferramentas e serviços de diagnóstico do disco rígido - Tacktech.com
Alguns setores defeituosos são normais após um período de uso. Você deve fazer backup dos dados críticos desse disco em uma base prioritária. A menos que a contagem do setor ruim seja extremamente alta, mantenha-a atenta, especialmente para aumentos repentinos. Quando isso acontecer, esteja preparado para pedir uma nova unidade.