Eu não penso assim. Como o último Explorer fechado sobrescreve as configurações de todos os outros ... Não acho que o Desktops forneça uma funcionalidade para separar as configurações por meio de reinicializações ainda.
Eu uso os Desktops de Mark Russinovich para organizar minhas janelas no meu computador de trabalho. É possível fixar diferentes programas na barra de tarefas de cada desktop virtual?
Por exemplo:
Desktops é um aplicativo que pode fazer o que você descreve. São apenas 60 kB.
Uma de suas deficiências é que você não pode transferir aplicativos entre diferentes áreas de trabalho.