Tem certeza de que / CPUID não está olhando ou relatando o status de uma das linhas de 3,3V? Eu pergunto porque, sim, 3V é muito baixo para uma linha de 12V.
Tão baixo que eu não esperaria que o seu computador estivesse funcionando se estivesse na voltagem. :)
Confira esta pergunta e respostas: Como testar uma fonte de alimentação?
Ele fornece algumas idéias sobre como determinar se as linhas de PSU estão funcionando e tal. Especificamente, as respostas sobre o PSU tester e usando um vários metros para testar as linhas individuais provavelmente valem a pena investigar.
Editar:
Além disso, verifique se há um driver de chipset atualizado para sua placa-mãe, pois o CPUID HW Monitor depende de um driver SMBus (System Management Bus) para fazer interface com os sensores, e muitas das interfaces SMBus na era P4 da Northwood ainda eram bem modestas.