O processo padrão é começar com uma única partição Mac (formato HFS +) e, em seguida, executar o Assistente do Boot Camp. Ele dividirá a unidade e criará uma partição FAT32 para Windows (que será convertida para NTFS posteriormente) e também executará alguns truques com o mapa de partições do disco para transformá-lo em um formato híbrido GPT + MBR (note: this is the razão pela qual você deve usar o BCA em vez de particioná-lo por conta própria). Então, você inicializa a partir do disco instalador do Windows, tem que reformatar a partição FAT para NTFS (note: tenha muito cuidado com isso, para não danificar o mapa de partição e / ou o volume do Mac - o BCA tem instruções, leia eles) e instalar o Windows. Por fim, insira o disco de instalação do OS X e o Windows o verá como um disco de instalação do driver (incluindo um driver para obter acesso à partição do Mac).
Observe que o Mac OS X pode ler NTFS, mas não pode (por padrão) gravar nele; você pode mudar isso (veja a resposta de Ryan para instruções), mas eu já ouvi falar de casos em que isso corrompeu o volume NTFS. A Apple deixa isso desativado por um motivo ...