Quem te informou isso está incorreto. Você não perderá dados alterando sua placa-mãe. Se você fosse por per se inicializar em qualquer sistema operacional que estava no disco rígido antigo, os problemas provavelmente surgiriam porque os drivers antigos em seu disco rígido antigo não seriam compatíveis com o novo hardware. Se você quisesse usar o disco rígido antigo para um segundo disco rígido em seu novo computador e inicializá-lo, você não desejaria inicializar em nenhum sistema operacional antigo (que estava instalado no equipamento antigo) por causa dos problemas que surgiriam. Pode ser sábio, depois de obter tudo o que você queria para limpar o disco ou excluir as partições no disco rígido antigo.
A ideia que você propôs funcionará em teoria, desde que não haja problemas com o driver. A placa-mãe deve ser capaz de reconhecer o disco rígido antigo. No entanto, você pode ter que instalar drivers para ele usando o Windows Update ou indo para o site do fabricante; no entanto, isso é extremamente improvável.
Lembre-se apenas quando você executar o seu plano, conecte o disco rígido antigo antes de ligar o computador, senão o sistema pode não detectar tal alteração. A placa-mãe e o SO, na maior parte do tempo, o reconhecerão como uma unidade durante a inicialização e serão exibidos como um volume no Windows.
EDIT solicitado pelo OP: Não há nenhuma maneira de desativar a capacidade de inicializar o disco rígido antigo, mas não vai atrapalhar nada para inicializar o sistema operacional do disco rígido antigo, ele pode não funcionar devido a problemas potenciais do driver devido a hardware diferente. (Basta desligá-lo com força se isso acontecer). No entanto, você pode alterar a ordem de inicialização dos discos rígidos nas configurações da BIOS (pressionando uma tecla na inicialização e navegando através dela). O nome do novo disco rígido deve estar listado na parte superior e o disco rígido antigo abaixo. Você também pode escolher apenas o menu de seleção de inicialização (ou nome similar) na inicialização pressionando uma tecla.
Se você quiser saber como limpar a unidade, depois de usá-la para a recuperação de dados, você pode: Abrir cmd , executar diskpart , selecionar uma unidade usando sel disk 52 após ser listado os discos com list disk e executando clean . Você também pode usar uma interface de usuário do Windows chamada "Gerenciamento de disco".