Se esse diretório estiver se comportando corretamente (ou seja, mostrando uma lista de arquivos em vez de gerar erros estranhos de E / S ou algo assim), então é um diretório e não um arquivo.
Mudar o tipo de inode lhe dará um sistema de arquivos corrompido, nada mais. (Você faria isso com ferramentas de depuração do sistema de arquivos, que são específicas do sistema de arquivos e muito perigosas - faça o backup do que puder antes de tentar qualquer coisa assim. Exemplo para os sistemas de arquivos ext do Linux: debugfs
.)
Parece que você deve procurar um software que reembale esse contêiner "extraído" em um único arquivo, se necessário.