Você poderia fazer pior do que usar a ferramenta de captura de tela scrot e abrir a captura de tela resultante diretamente em gimp :
scrot -q 100 -e 'gimp $f'
Você pode definir essa linha de comando em particular para uma chave, ilustro aqui mapeado para F6 :
Ou você pode simplesmente executá-lo a partir da linha de comando com a adição gloriosa de um temporizador e atraso:
scrot -d 10 -c -q 100 -e 'gimp $f'
O gimp deve resolver as suas necessidades de manipulação de imagens e existem muitas outras configurações de scrot que você pode adaptar às suas necessidades ...