Desta pergunta do StackOverflow Bash: How colocar comentário de linha para um comando de várias linhas? esta resposta :
Essencialmente, usando a substituição de comandos do bash de bash, pode-se colocar esses comentários em qualquer lugar ao longo de longa linha de comando, mesmo se estiver dividida em linhas. Eu coloquei o comando echo na frente do seu exemplo para que você possa executar o exemplo e ver como ele funciona.
echo CommandName InputFiles '#1st comment' \
--option1 arg1 '#2nd comment' \
--option2 arg2 '#3rd comment'
Outro exemplo onde você pode colocar vários comentários em pontos diferentes em uma linha.
some_cmd --opt1 '#1st comment' --opt2 '#2nd comment' --opt3 '#3rd comment'