Na maioria das situações: não, não vai. Se você estiver conectado por LAN e simplesmente conecte ambas as interfaces, mesmo que consiga dizer ao NAS para enviar dados sobre ambos, isso não lhe dará um aumento de velocidade. A pergunta simples é: qual é o elemento limitante? Como mencionado no comentário, muitas vezes o disco rígido é isso. Às vezes, a taxa de transferência da conexão (não realmente em uma lan, mas talvez se sua conexão passar pela WLAN) limita a taxa de transferência. Mas se já estiver acostumado com sua capacidade máxima, como deve ser mais rápido se você tiver duas conexões? Na maioria dos casos, fica ainda mais lento.
Então, para que serve a porta diferente? - Uma segunda porta é ótima. Se você tem uma rede mais complexa. Do fato de que seu NAS tem duas portas, eu assumo que não é barato, com muitas funções. Por exemplo, você pode construir duas redes LAN, uma com seus computadores particulares em casa, onde você compartilha suas fotos e músicas, e uma onde você gosta de experimentar ou até mesmo hospedar alguns serviços web sérios. É bom separar essas duas redes. Seu NAS - sendo muito poderoso - agora pode fornecer funções que você gostaria em ambas as redes, por exemplo, compartilhamento de dados ou acesso à VPN. Agora você pode escolher a qual rede as funções serão aplicadas. Por exemplo. hospedar sua música favorita no site privado e algum código-fonte do kernel linux no outro. Agora você tem alguns amigos que gostam de codificação e você gostaria de conceder-lhes um acesso à sua rede - vamos chamá-lo de "dev". Você faz isso com o seu fabolous NAS e eles podem se tornar um membro completo da sua rede de desenvolvedores. Para sua família, você configura uma vpn para sua rede privada, onde eles podem sempre ver suas fotos favoritas.
Então, para concluir, é principalmente por razões de segurança / infra-estrutura. Espero que esta explicação não seja muito longa .. =)