O Excel 2010 abre todos os arquivos na mesma instância, a menos que você queira abrir outra instância do Excel.
Mas mesmo que seus arquivos estejam abertos na mesma instância do Excel, você pode visualizá-los lado a lado.
Basta clicar na faixa Ver e selecionar "Organizar tudo" > "Vertical" > "OK" e todos os arquivos atualmente abertos nesta instância do Excel serão organizados em janelas alinhadas verticalmente.
Se você clicar em "Visualizar lado a lado", o arranjo mudará para uma divisão horizontal (muito obrigado, Microsoft, não é o que queremos, mas de qualquer maneira) e você pode rolar os dois arquivos simultaneamente.