Se eu entendi corretamente o modo como o Nvidia Optimus funciona, as configurações do painel de controle Intel Graphics afetarão os aplicativos usando os gráficos integrados, enquanto as configurações do painel de controle da Nvidia serão aplicadas aos aplicativos em execução no GPU discreto. (Tudo o que realmente está acontecendo é que, quando a GPU da Nvidia está em uso, ela está copiando sua saída para o framebuffer da GPU Intel para exibição - além disso, eles são totalmente separados, o que deve significar que não há sobreposição alguma entre os dois painéis de controle.)