O processo de aceleração / desaceleração é muito pior em um disco rígido do que deixá-lo em 24x7.
Dito isto, não há resposta única para todos, e você pode ter discos rígidos que funcionam 10 anos depois, desligados e ligados algumas vezes por dia e outros que se apagam dentro de um ano após 24x7. .
Além disso, tenho visto alguns invólucros USB ruins que mantêm a unidade girando na velocidade máxima 24x7 e podem causar curto tempo de vida (não uso mais o meu gabinete Thermaltake antigo por esse motivo).
Só você pode realmente julgar isso e suas necessidades ... Desculpe!
Além disso, aqui está uma pergunta interessante do Server Fault .