Aparentemente o ActiveDesktop foi habilitado em algumas configurações do Registro, mesmo que não seja aparente no Painel de Controle.
Na seguinte chave, mudei o ForceActiveDesktopOn de 1 para 0 e reiniciei:
HKEY_CURRENT_USER \ Software \ Microsoft \ Windows \ CurrentVersion \ Políticas \ Explorer
Agora vejo as cercas, retângulo de seleção translúcido, o fundo do texto do ícone é transparente e os ícones não têm as bordas irregulares.
Obrigado àqueles que ajudaram de qualquer maneira.