No menu Favoritos, escolha Gerenciador de favoritos. Na página que se abre, clique no menu "Organizar". Você deve ver um item "Exportar favoritos ...".
Note que estou usando a versão 5.0.375.23 dev - do canal de desenvolvimento do Chrome . É possível que a versão do Chrome que você está executando ainda não tenha o gerenciador de favoritos. Ele foi adicionado ao lançamento do canal de desenvolvimento em janeiro ( artigo do TechCrunch sobre esse lançamento 01 de janeiro de 2010).