Use o BCDEdit para remover a entrada que você não deseja.
Eu estava rodando o Vista 64, eu instalei (não atualizei, nova instalação) o Windows 7 64 bit na mesma partição, mas desde então ele tem trazido um menu de boot duplo perguntando se eu quero inicializar para o 7 ou Vista. Qualquer maneira de se livrar disso, eu realmente não estou interessado em retroceder.
Use o BCDEdit para remover a entrada que você não deseja.
Eu ainda uso EasyBCD 1.72, que é afaik, a última versão freeware. Ele funciona no XP, Vista e W7. Eu sugiro isso como uma alternativa.
PS. Se a pontuação realmente importa para os poderes, gostaria de apontar o seguinte erro de ortografia no site. É "eu gostaria de melhorar minha resposta!" não "Eu gostaria de melhorar minha resposta!"