O que você deseja é não suprimir a notificação, mas mostrar uma mensagem personalizada.
Infelizmente, que eu saiba, não é nada que imite esse comportamento específico. Usando o gnome, há extensões como as seguintes, que modificam a aparência / exibição da notificação, encontre essa aqui .
Se isto não é para o seu gosto, escolha um e dê uma olhada no código-fonte, você provavelmente poderia trabalhar em algo.