Embora compartilhem muitos recursos em comum, eles são protocolos completamente separados, com espaços de endereço completamente separados. Para um host IPv4 se comunicar com um host IPv6, você precisaria usar um sistema de tradução, como NAT64 , que faz o conversões necessárias. Existem problemas com essa abordagem, especialmente com protocolos que assumem um formato de endereço específico, mas podem ser feitos para (principalmente) funcionar.
Uma abordagem melhor, se você puder, seria obter um túnel IPv6 para que você não o faça tem que passar por um tradutor.