Existe um utilitário chamado XdoTool que pode fazer o que você deseja. Tenha em mente que a sua atividade é muito fácil de detectar se você é o objeto Flash ou o servidor Web, então quase certamente não funcionaria para qualquer coisa "irregular".
Havia uma ferramenta semelhante que era muito mais difícil de detectar, mas exigia remendar a distribuição X e era tão agradável quanto mastigar vidro quebrado (eu tive que trabalhar nisso para simular um usuário com doença de Parkinson para um projeto de usabilidade).