Você provavelmente precisará reinstalar o Kali. O Windows não funciona bem ao instalá-lo em um sistema que já tenha outro sistema operacional instalado primeiro. Normalmente, ao configurar um sistema de inicialização dupla, você sempre quer instalar o Windows primeiro e depois instalar o Linux em segundo lugar.
Em PCWorld:
When you install Windows after Linux, Windows ignores Linux, doesn’t know how to resize its partitions, and overwrites the Linux boot loader with its own.
Como você não estava começando do zero, você não teve a opção de instalar o Windows primeiro, já que essa é uma reinstalação do Windows em um sistema que já tinha uma partição Linux preexistente. Em um caso como esse você pode tentar reparar o Grub primeiro se você realmente quiser tentar salvar sua partição Kali. Se não há nada que valha a pena salvar, apenas reinstale o Kali.
Há alguma chance de o Windows ter substituído o Grub apenas pelo seu próprio gerenciador de inicialização e não ter apagado a sua partição do Kali, então você pode simplesmente reparar o Grub e esperar que tudo o mais tenha sido deixado intacto. Um método para fazer isso é inicializar em um Linux USB / CD ao vivo e reparar o Grub conforme descrito aqui em help.ubuntu.com :
- Insert your Ubuntu CD, reboot your computer and set it to boot from CD in the BIOS and boot into a live session. You can also use a LiveUSB if you have created one in the past.
- Install and run Boot-Repair.
- Click "Recommended Repair".
- Now reboot your system. The usual GRUB boot menu should appear. If it does not, hold Left Shift while booting. You will be able to choose between Ubuntu *(in your case, Kali) and Windows.