O navegador padrão é definido no Registro em
HKCU\SOFTWARE\Classes\http
e
HKCU\SOFTWARE\Classes\https
Essas configurações do usuário têm precedência sobre aquelas em HKEY_CLASSES_ROOT, que podem ser ignoradas.
Você pode clicar com o botão direito do mouse na chave de comando e alterar as permissões, portanto, é menos provável que o Windows altere suas configurações na próxima atualização.
Você também pode criar um pequeno arquivo .reg, exportando essas configurações, então da próxima vez que o MS o fizer, ele precisará ser mesclado no Registro.