Ele ainda seria chamado de diretório e dependeria da sua definição de "mais profundo". Existe um limite de caminho de 260 caracteres, mas esse não é o limite real de diretórios aninhados. Existem APIs disponíveis que permitem a você contornar esse limite, mas isso depende do software e de como ele está implementando o acesso ao arquivo.
Para testar, crie um item (diretório ou arquivo) com um nome próximo ao limite de 260 caracteres e mova-o para uma pasta, de modo que ainda não exceda o limite de 260 caracteres. Depois disso, você pode Recortar e Colar essa pasta em uma pasta com um nome mais longo (para que o caminho para o item exceda o limite de 260 caracteres) e você teria um arquivo que pode ser acessado por alguns (Total Commander), mas não todos. (Explorer).
Você também pode examinar a seguinte pergunta sobre o SuperUser para obter algumas informações sobre quantos arquivos podem ser armazenados usando NTFS, o que provavelmente indica a profundidade máxima de uma estrutura de diretórios - supondo que você não armazena mais nada em uma partição: < a href="https://superuser.com/questions/446282/max-files-per-directory-on-ntfs-vol-vs-fat32"> Máximo de arquivos por diretório no NTFS vol vs FAT32
Como o NTFS funciona sugere:
Files per volume 4,294,967,295 (2³² minus 1 file)