No VirtualBox você tem algumas opções em termos de segurança de seus dados dentro de um Drive virtual
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Você pode criptografar seu disco VM dentro do VirtualBox. Você deve sempre desligue a VM com esta opção e não use Sleep, Hibernate, etc ...
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Você pode usar uma ferramenta de criptografia de terceiros para criptografar todos os arquivos da VM
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Por fim, você pode criptografar o disco do sistema host
Com todas essas opções, você não deve usar as funções Suspender, Hibernar ou suspender os sistemas do Host enquanto a VM estiver ativa e funcionando, em vez disso, você deve sempre desligar completamente a VM quando terminar.