Eu tenho medo que você não espere por uma resposta positiva. A Microsoft parece muito interessada em atrair clientes para o uso do OneDrives (o espaço do SharePoint). Presumivelmente, uma vez que você tenha usado muito do seu espaço ilimitado, será praticamente impossível deixar a plataforma.
A Microsoft reconheceu problemas irrecuperáveis com o cliente OneDrive for Business e os substituirá antes do final deste ano por um novo cliente baseado no atual OneDrive (versão do consumidor). Isso permitirá uma sincronização mais confiável e também permitirá sincronização seletiva (extremamente importante em contas ilimitadas com laptops baseados em SSD!)
A limitação que você menciona, no entanto, não é, penso eu, nos requisitos para o novo cliente e talvez você deva levantá-lo como uma necessidade em seus fóruns. Eles estão sendo notavelmente responsivos no momento, então você pode até obter um resultado.
Outros problemas com o OneDrive for Business incluem a falha repetida e comum de sincronização para sites de equipe e a falha de sincronização não tão comum (mas também não é rara) no OneDrive.