Ok - então a resposta para essa pergunta foi alterar o local do local padrão para colocar os arquivos.
De acordo com esta postagem , é necessário modificar o arquivo: IntelliJ IDEA_home\bin\idea.properties
e descomente os valores para:
idea.config.path
idea.system.path
e defina-os para outro local, por exemplo, c:\temp\intellij\config\
e c:\temp\intellij\system\
.