Sim, você pode removê-los, é extremamente raro que um programa precise de uma versão antiga do java.
Na verdade, a coisa "segura" a fazer é desinstalar o 6 update 39 também e instalar a versão mais atual disponível do site .
Eu tenho um PC que quando você lista os programas instalados mostra:
Java(TM) 6 Update 2
Java(TM) 6 Update 3
Java(TM) 6 Update 5
Java(TM) 6 Update 7
Java(TM) 6 Update 39
É seguro excluir todos, exceto o mais recente?
Sim, você pode removê-los, é extremamente raro que um programa precise de uma versão antiga do java.
Na verdade, a coisa "segura" a fazer é desinstalar o 6 update 39 também e instalar a versão mais atual disponível do site .