Existem ferramentas com cada distribuição (geralmente GParted ou uma variante) que o processo de instalação usa para criar o sistema de arquivos e montar os dispositivos apropriados onde eles precisam ir. Então, uma série de scripts faz o resto.
O Linux usa o método "Live OS" para instalar - copia os itens essenciais para inicializar uma versão simplificada do sistema operacional para executar o instalador. É por isso que você pode "experimentar antes de instalar" muitas distribuições populares sem afetar nenhum sistema operacional existente.
Então, pense nos passos dessa maneira:
Inicialização CD / USB - > GRUB (bootloader) - > OS ao vivo - > Instalador - > Etapas de GParted / Instalar