Sim. Ao criar sua VM, você desejará criar um disco virtual separado para os dados do seu diretório pessoal. No Gerenciador de Mídia Virtual VirtualBox (File - > Gerenciador de Mídia Virtual) encontre o disco do seu diretório pessoal e selecione "Modify" e mude o modo para "Writethrough".
Do Manual do VirtualBox :
By contrast, write-through hard disks are completely unaffected by snapshots: their state is not saved when a snapshot is taken, and not restored when a snapshot is restored.