Se funcionar, você pode pausar temporariamente a sincronização do Dropbox e ativá-la depois de concluir seu trabalho com o este script python. Ele só funciona para o Dropbox 0.7.xe 0.8.x embora.
Além disso, há muitos addons do Dropbox em esta página da Web para várias linguagens e plataformas de codificação.
Além disso, com este método você pode chamar scripts python do Matlab.