Use um link, é mais seguro e eu nem tenho certeza se o Windows pode lidar com hard links do Linux, eu não sei como o NTFS lida com hard links.
No entanto, faça o contrário. Você deseja vincular seus documentos do Windows ao seu Linux $HOME :
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Primeiro, certifique-se de que
/mnt/data/.../Documentsesteja atualizado, copiando os arquivos mais recentes de~/Documents:cp -ruv ~/Documents/* /mnt/data/.../Documents -
Em seguida, exclua o diretório
~/Documents( certifique-se de que a etapa acima funcionou primeiro ) e crie o link:rm -r ~/Documents ln -s /mnt/data/.../Documents ~/Documents
Dessa forma, o Linux simplesmente tratará o diretório /mnt/data/.../Documents como seu ~/Documents . Todo o processo é transparente para o Windows, para que você não precise se preocupar com problemas de compatibilidade do sistema de arquivos.