Depois de ficar frustrado com esse problema, decidi instalar o VMWare ESXi 5.0 para instalar o FreeNAS 8.3 como uma VM guest. Não consegui instalar o ESXi 5 com êxito, mas finalmente consegui fazer o downgrade do BIOS para a versão 1.8 e tive que usar o ESXi 4.1. Pelo que encontrei no Google, a versão 1.8 do BIOS foi bem-sucedida com o IOMMU para virtualização e o ESXi 4.1 não teve problemas. Uma vez que o ESX 4.1 estava em funcionamento, tentei instalar o FreeNAS em uma VM, mas tive mais problemas e reverti para o plano original de obter o FreeNAS 8.3.
Eu decidi recriar o disco FreeNAS, mas em vez de usar o Windows 7, usei meu Macbook Pro. Além disso, atualizei o BIOS para a versão mais recente (1.15 se bem me lembro). Depois de fazer as duas coisas, consegui inicializar a partir da unidade de DVD.
Não tenho certeza do que concluir. Eu queimei a primeira imagem ISO no Windows 7 e consegui inicializar do disco em duas outras máquinas. De qualquer forma, eu consegui instalar o FreeNAS 8.3 apenas após atualizar o BIOS e recriar um novo disco para instalar usando o Mac OSX, não o Windows 7.