Se você observar a história dos sistemas de arquivos, cada um deles foi desenvolvido com a tecnologia atual em mente. Como exemplo, o fat32 que chegou com o Windows 95 tem um limite de tamanho de arquivo de 4 GB. Agora, na maioria dos computadores, o pagefile.sys e o hiberfil.sys são maiores que 4 GB. Quando a Microsoft percebeu que precisava superar esses e outros limites, desenvolveu o NTFS.
O desenvolvimento de sistemas de arquivos segue de perto o sistema operacional que eles devem suportar. A história do Ext2 / 3/4 segue o desenvolvimento do kernel do linux que os utiliza. Provavelmente nunca haverá um 'grande sistema de arquivos unificado' para discos locais porque está muito ligado ao desenvolvimento do sistema operacional e, na realidade, a diversidade é uma coisa boa.
É mais provável que você veja a unificação de sistemas de arquivos do tipo de rede. Neste ponto, temos o protocolo CIFS / SMB que quase todos os sistemas operacionais suportam.