Até onde eu sei, ao ler a documentação sobre como alterar as configurações do Flash e o painel de controle relacionado, não é possível alterar o local. Um comentário no final da pergunta Como limpar o cache e as configurações do Flash Player? no Flash Player FAQs diz isto:
You can also manually accomplish this task by deleting the contents of the following folders:
Windows (tip: copy and paste these paths into the path bar in an Explorer window)
%appdata%\Adobe\Flash Player %appdata%\Macromedia\Flash Player
Macintosh
~\Library\Preferences\Macromedia\Flash Player\ ~\Library\Caches\Adobe\Flash Player\