O disco virtual irá não sobrescrever os dados do seu disco rígido. O particionamento apenas ocorre dentro do disco virtual que você criou, não no disco rígido real.
É chamado de "virtual" porque é simplesmente um arquivo VDI que é de tamanho fixo (o tamanho do arquivo é o que você definiu) ou dinamicamente expandido (começa pequeno, o tamanho do arquivo aumenta à medida que você escreve mais dados).