Para realmente responder à sua pergunta, embora eu acredite que usar lampp não seja uma coisa boa:
Tente usar um link simbólico . Mude para o diretório htdocs
e faça algo como sudo ln -s /home/<your user name>/Documents/my_website my_website
onde ~/Documents/my_website
é um diretório no qual você pode colocar todos os seus scripts PHP. Certifique-se de que esta pasta existe. Isso é agora testado e funciona para mim.