Quando você diz "windows network", quer dizer que tem uma rede do Windows com um Active Directory? Uma possibilidade que você deveria estar olhando para o DFS-R. Versões mais recentes do DFS-R observam o sistema de arquivos e apenas transmitem mudanças. Se você tiver 5 milhões de arquivos, talvez esteja se aproximando do DFS limites embora.