Isso parece um problema de driver, já que o ventilador a que você está se referindo é provavelmente o ventilador da placa de vídeo. Algumas placas de vídeo têm ventiladores que funcionam a toda velocidade até que o software controle a velocidade do ventilador; Por exemplo, eu tenho um sistema Linux com uma placa Nvidia GeForce GT 220 que é muito barulhenta a menos que o X Window System esteja rodando, quando os drivers cheios estiverem carregados. Você precisa adicionar drivers de vídeo apropriados ao disco PE para que haja um software para controlar a ventoinha da placa de vídeo.