Tente executar strace monodevelop e procure erros relacionados a permissões.
Minha nova instalação do monodevelop (seja qual for o repositório padrão do ubuntu) em uma nova instalação do 10.04 parou de funcionar após apenas um teste. Como queria obter a versão mais recente, removi-a e fiz um autoremove para limpar os arquivos desnecessários. Em seguida, executei a atualização do sistema e, em seguida, instalei a versão 2.4. Mas nada mudou. Clicar no lançador (ou fazer monodevelop > entrar em "executar" ou terminal só abre a tela inicial por uma fração de segundo que desaparece sem deixar vestígios.
No entanto, eu apenas tentei (sem motivo aparente) "gksu monodevelop" e funcionou normalmente. Alguém pode explicar por que isso está acontecendo e como isso pode ser corrigido?
Obrigado.