Problemas de sincronização de áudio WMV com a taxa de quadros. Enquanto a maioria dos vídeos normalmente seria 29.97, os WMVs são executados a uma taxa de quadros variável (VFR) ou são executados às 29.00. É muito chato.
Então, há algumas coisas para tentar. A primeira é que, se você puder evitar o uso do WMV como um formato de arquivo intermediário, evite-o.
Caso contrário ...
Tente isto: link
Se isso não ajudar, tente importar o WMV para o Movie Maker do Windows e exporte como DV-AVI.