Pelo que parece, o seu disco rígido está impedindo você. O limite de velocidade que você está obtendo já não é muito reflexivo de uma limitação de hardware gigabit de 35MB / s == 280Mb / s. Pela sua descrição, também parece que você está lendo e escrevendo no mesmo disco.
O software de teste comparativo de disco pode dar uma boa ideia da velocidade do disco rígido, mas lembre-se de que, se você estiver lendo e gravando no mesmo disco com FTP, os resultados do benchmark serão maiores do que os obtidos as operações de FTP, uma vez que o software só faz referência a uma operação de cada vez (leitura ou escrita). Você pode verificar suas velocidades de leitura / gravação de seu disco rígido usando uma ferramenta como DiskBench :