Em que hardware você está executando isso?
Eu achei o FireFox 3.x frequentemente pausado visivelmente (embora não por até dez segundos) ao visitar novos sites no meu netbook (com seu SSD lento) devido à atualização do arquivo sqlite que alimenta o processo de verificação de site incorreto. Isso foi introduzido no FF3, então pode não ter estado presente na sua instalação do Ubuntu 8.x.
Para ver se a E / S do disco é o gargalo que você está vendo, execute top
em uma janela do console e veja qual é a% de leitura de espera durante essas pausas. Além disso, você pode tentar iotop
para confirmar que qualquer grande grupo de operações de E / S que você vê é de fato diretamente devido ao FireFox.
No meu netbook, que tem mais RAM do que o necessário para a operação do dia-a-dia, resolvi esse problema movendo meu perfil do FireFox para uma unidade RAM (e sincronizando-o de volta à cópia no SSD ocasionalmente, quando Eu fiz alterações como atualização de favoritos ou suplementos). Ainda estou usando o FF3.x, não o 3.5.x que vem com o Ubuntu 9.10, então não posso dizer com certeza se esse comportamento seria o mesmo na versão mais recente.